BioEchos 基因组 DNA 提取技术——全新、智能、创新!

基因组DNA制备技术现状

基于二氧化硅的技术及复杂的结合-洗涤-洗脱程序,多年来一直用于各种核酸纯化,例如从组织中提取DNA。这些是常用的,主要是习惯问题,也因为缺少替代方案。然而,在许多情况下,用户样本被损耗一部分,例如在下游应用(如PCR)中灵敏度降低甚至丢失。导致当今常见基因组DNA制备的结果和DNA质量不佳的主要原因有两个:细胞壁的不完全裂解和苛刻的非生理纯化条件,存在残留有机溶剂或盐。

裂解液、高盐工作条件的缺点

纤维组织和其他难以裂解的组织需要在复杂的方案中进行处理,但仍会导致裂解不完全,因为它们仅基于蛋白酶K作为裂解蛋白质、较大复合物和细胞壁的唯一酶活性。高盐条件,如8 M GuHCl。此外,其他样本类型,如大脑、纤维和脂肪组织,也会受到这些不适当的裂解条件的影响。随后的复杂的硅胶纯化技术在高浓度离液盐和有机溶剂存在的情况下将 DNA结合到膜上,随后用水或水性缓冲液洗脱DNA。整体过程引入了机械力,与核酸相互作用,此外,每个结合、洗涤或洗脱步骤都与产率的固有损失有关。操作过程中使样品总产量和DNA长度降低,而混入纯化盐和有机溶剂的风险增加。经常由于残留抑制分子或仅少量DNA导致酶依赖性分析(例如 PCR)的灵敏度降低目前,大多数实验室仍然使用这项技术,是因为缺少替代品。

BioEcho EchoLUTION DNA 提取技术

BioEcho专家努力通过一种特别创新和方便的技术克服上面描述的缺点,该方法这不仅提高了样品纯度DNA完整性和产量,而且还缩短了获得结果的总时间。EchoLUTION 样品过程完全在保护DNA的水相生理条件下工作,包括极其高效和温和的专有裂解环境,基于逆向色谱优化原理的独特单步纯化方法:DNA 通过柱基质而不会相互作用,杂质被阻止并去除。

高效裂解效率

初始裂解步骤蛋白酶的酶活性通常会增加,从而在很短的时间内获得高提取效率。TurboLyseTM Protease Mix含有多种活性酶的独特组合,具有扩展的底物特异性和gDNA保护成分。这种专有组合推动了整个过程:可以使用相同的方案快速而成功地裂解所有类型的细胞和组织。不再需要机械破坏或长时间的裂解。

基因组DNA纯化只需一步

EchoLUTION 单步离心纯化程序结合了初始过滤(阻止潜在细胞碎片)和极其有效的反向纯化离心柱。澄清的裂解液直接加载到离心柱上。仅旋转一次后,纯化的高分子量基因组DNA就被洗脱,同时所有碎片和细胞区室、抑制剂、小片段 (< 50 bp)、核苷酸和盐都被去除。杂质被纯化基质阻挡,高纯度的DNA被收集在收集管中。纯化的DNA很容易以接近100%的效率回收,且不含会干扰下游应用或影响OD测量值的残留物质。

简单的工作流程和更高的DNA产量

BioEcho 程序简单、方便:EchoLUTION技术比常见的基于二氧化硅的方法快3倍。离心步骤从8步减少到最多3步,总处理步骤从>20减少到8步,方案持续时间从几小时减少到30分钟。一种方案可以应用于各种组织或细胞,使实验室过程比以前更加轻松。此外,化学和物理DNA损失的风险大大降低,例如剪切高分子量分子-目标核酸在整个工作流程中保持不变。

BioEcho DNA提取试剂盒的高性能和可靠结果

由于 EchoLUTION 纯化的DNA不含污染物和酶抑制剂,如离液试剂和有机溶剂,而且由完整的DNA片段组成,因此非常适合所有下游实验。特别是在灵敏度非常重要的实验中,例如使用有限样本材料的 qPCREchoLUTION 纯化的DNA优于使用硅胶技术纯化的 DNA获得的结果。

使用EDTA处理的试管从供体采集全血,并通过琼脂糖凝胶电泳进行提取和分析。A、使用供应商Q提供的硅基试剂盒或

EchoLUTION血液DNA微量试剂盒(EL)纯化来自捐赠者1和捐赠者260µl人类血液。B、从60µl血液(牛、狗、猫)中纯化

DNAC、基因组DNA使用EchoLUTION血液DNA微量试剂盒从指定卡片类型上干燥的每个血液样本(一式两份)中制备。A-C

将每种100µl洗脱组分中的6µl加载到凝胶上。

 

EchoLUTION工作流仅基于水溶液-不需要苯酚、胍(GuHClGITC)或有机溶剂等超营养试剂。由于清洗步骤从未完 成,因此二氧化硅制备剂中含有微量杂质(D),EchoLUTION样品的纯度很高(E)。OD比率证实了这一点,其中 BioEcho洗脱液的值通常在最佳范围内,二氧化硅经常处于关闭状态。通过分光光度法分析制备的二氧化硅靶定量可能会 产生误导,因为一些共纯化杂质(例如RNA或小DNA片段)也会在260nm处吸收。因此,硅基纯化的DNA产量和纯度经 常被高估(见图F)。将这些DNA部分应用于PCRNGS反应可能会导致结果受损,而EchoLUTION纯化的DNA可产生优越的下游性能(参见qPCRG)。

二氧化硅和EchoLUTION gDNA组分的纯度评估。对从全血(供体

1A)中获得的未稀释DNA进行分光光度分析。仅在二氧化硅洗脱

部分中检测到杂质(DE10倍浓缩洗脱部分的测量)

可持续

由于Gu HCl具有刺激性、腐蚀性,因此必须谨慎使用,并且必须单独处理受污染的塑料废物和液体成本高昂!BioEcho愿景的一部分是开发可持续、环保的实验室流程,减少实验室过程中消耗的基于塑料的套件组件。由于采用方便的单步纯化技术,与硅胶对应物相比,塑料浪费减少了70%,并且不需要有害液体。BioEcho的套件和离心柱包装完全不含塑料,仅以纸箱或玉米淀粉为基础,从而进一步节约了自然资源。使用BioEcho产品的决定将有利于实验室安全和健康以及财政资源。

概括

用于纯化基因组DNABioEchos EchoLUTION 技术将高效、方便有效的裂解与非常方便和快速的离心柱纯化相结合。温和而强大的工作流程可产生高纯度和完整的基因组 DNA。它完全不含污染物和酶抑制剂,如离液试剂和有机溶剂,非常适合所有下游实验,如 PCRqPCR、基因分型和NGS应用。

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